В последнем фильме о Черепашках-ниндзя, "Мутантский хаос", братья Черепахи должны завоевать любовь Нью-Йорка и одновременно столкнуться с армией мутантов. После обвинения в преступлении, которого они не совершали, Черепашек вынуждают бежать.
Но, пока они пытаются оправдаться, они замечают, что в городе происходят странные события. Мутанты появляются повсюду, и кажется, что никто не в безопасности. Черепашки знают, что только они могут остановить этот безумный хаос, но им понадобится помощь, чтобы спасти Нью-Йорк от мутантского хаоса.